El club va néixer el 3 d'octubre de l'any 1909, com una secció del Circolo Turistico Bolognese, amb el nom de Bologna Foot Ball Club. El 1926 adoptà el nom Bologna AGC i el 1943 el de FC Bologna. La seva millor època fou durant els anys 20 i 30, en què fou un dels millors club italians.
Des del 1927 juga a l'estadi Renato Dall'Ara, que al llarg de la història ha rebut els següents noms, des de 1927 Stadio Littoriale, el 1946 Stadio Comunale i l'actual des de 1983.